1) 生物有机肥营养元素齐全;化肥营养元素只有一种或几种。

　　2) 生物有机肥能够改良土壤;化肥经常使用会造成土壤板结。

　　3) 生物有机肥能提高产品品质;化肥施用过多导致产品品质低劣。

　　4)生物有机肥养分含量高;精制有机肥由于高温处理，造成了养分损失。

　　5)生物有机肥已经除臭，气味轻，几乎无臭;精制有机肥未经除臭，返潮即出现恶臭。

　　6)生物有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗;精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。

　　7) 生物有机肥能改善作物根际微生物群，提高植物的抗病虫能力;化肥则是作物微生物群体单一，易发生病虫害。

　　8)生物有机肥经高温腐熟，杀死了大部分病原菌和虫卵，减少病虫害发生;精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。

　　9)生物有机肥中添加了有益菌，由于菌群的占位效应，减少病害发生;精制有机肥由于高温烘干，杀死了里面的全部微生物。

　　10) 生物有机肥能促进化肥的利用，提高化肥利用率;化肥单独使用易造成养分的固定和流失。精制有机肥是畜禽粪便经过烘干、粉碎后包装出售的商品有机肥。