有机奶粉是典型的无污染、无公害、安全、优质、营养的有机食品，是处于食品安全级别金字塔顶端的一类食品。有机奶粉的奶牛不能使用激素、抗生素等化学药剂，牧草也不可使用农药、化肥、除草剂，牧场环境的空气、水源、土壤质量均需满足有机标准，简单概括就是生产加工过程的“安全性高”。
有机食品处于食品安全的金字塔顶端一方面原因与有机认证十分严格有关，比如近日，市场监管总局在官网发布通告称，市场监管总局对有机产品认证领域(有机蔬菜、食用菌、葡萄酒、茶叶、水果、粮谷、乳制品、食用植物油、婴幼儿配方食品9类产品)的25家认证机构涉及的320批次产品实施了认证有效性抽查，认证机构覆盖率为28.7%。抽查发现18批次抽样产品(涉及8家认证机构)不符合认证要求，总体不符合率为5.63%，其中并没有涉及婴幼儿配方奶粉。
市场监管总局表示，已将相关信息通报有关认证机构，有关认证机构已依据相关规定，对不符合认证要求的获证产品作出撤销24张有机产品认证证书的严肃处理。对抽查发现严重不符合(违规使用禁用物质等情况)被撤销认证证书(详见附件)的相关产品，认证机构5年内不得受理该企业及其生产基地、加工场所的有机产品认证委托。由此可见有机认证管理十分严格。
有机认证是有机农产品认证的简称。有机认证是一些国家和有关国际组织认可并大力推广的一种农产品认证形式，也是我国国家认证认可监督管理委员会统一管理的认证形式之一。有机认证是对产品本身的证明，而且也形成了以有机牧场、有机奶牛、有机加工、有机追溯、有机认证为核心的五大标准，这也是保护消费者权益。
另一方面也和严苛的“五大有机体系”有很大关系。有机奶粉的“五大有机体系”包括：有机牧场、有机奶牛、有机加工、有机追溯、有机认证五个方面。
有机牧场：从普通牧场转到有机牧场的有机土壤期为3年，期间不能使用化学肥料等;
有机奶牛：有机奶牛的饮食和养殖对化学成分的摄入要求极其苛刻，并且要求给与一定的户外自由运动;
有机加工：生产时所用的设备全部是有机专用，而且需要符合有机加工标准;
有机追溯：在有机奶粉的生产和流通过程中，必须有完善的质量控制和跟踪审查体系，有完整的生产和销售纪录档案。通过注册的有机奶粉都必须有“有机编码”，且有机编码均可在中国认监委官网查询;
有机认证：获得有机认证就需要要将有机原料达到95%以上，这也代表着有机奶粉的配方会相对简单一些。此外，在中国销售的进口有机奶粉一般会获得原产国及中国双重有机认证。
